可視化生信分析平臺(tái)

系統(tǒng)

模塊

功能說明

備注

平臺(tái)操作系統(tǒng)

文件系統(tǒng)

用于兼容硬件層不同的文件系統(tǒng)

必選

計(jì)算系統(tǒng)

用于計(jì)算任務(wù)的調(diào)度和生命周期管理

計(jì)算系統(tǒng)管理平臺(tái)

底層任務(wù)和集群的監(jiān)控和管理，用于監(jiān)控和管理集群中任務(wù)的運(yùn)行狀況，管理集群狀況

管理員系統(tǒng)

用戶管理

添加、刪除用戶，修改用戶信息

權(quán)限管理

為不同用戶設(shè)置可以使用的功能權(quán)限

項(xiàng)目管理

用于進(jìn)行項(xiàng)目推送、數(shù)據(jù)推送，查看推送隊(duì)列

用戶系統(tǒng)

用戶系統(tǒng)

用戶注冊(cè)、登陸、認(rèn)證系統(tǒng)，用戶信息管理

站內(nèi)信

管理用戶的站內(nèi)信，用于接收通知等內(nèi)容

數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)

我的數(shù)據(jù)

圖形化的數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)，包含公共數(shù)據(jù)和個(gè)人數(shù)據(jù)，支持頁面或ftp上傳數(shù)據(jù)

項(xiàng)目管理系統(tǒng)

我的項(xiàng)目

將項(xiàng)目進(jìn)展、任務(wù)、數(shù)據(jù)、報(bào)告統(tǒng)一放到項(xiàng)目中進(jìn)行管理

我的任務(wù)

監(jiān)控和處理運(yùn)行的任務(wù)和歷史任務(wù)

分析系統(tǒng)

分析平臺(tái)

可選擇分析平臺(tái)包含：
真核生物有參考基因組的轉(zhuǎn)錄組分析平臺(tái)；
真核生物無參考基因組的轉(zhuǎn)錄組分析平臺(tái)；
小RNA測(cè)序分析平臺(tái)；
circRNA測(cè)序分析平臺(tái)（只有標(biāo)準(zhǔn)分析）；
長(zhǎng)鏈非編碼RNA測(cè)序分析平臺(tái)；
全轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析平臺(tái)（只有標(biāo)準(zhǔn)分析）；
有參全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組（ONT）分析平臺(tái)（只有標(biāo)準(zhǔn)分析）；
蛋白質(zhì)組分析平臺(tái)；
代謝組分析平臺(tái)；
微生物多樣性分析平臺(tái)；
全基因組重測(cè)序分析平臺(tái)；
外顯子組測(cè)序分析平臺(tái)；
ChIP-Seq分析平臺(tái)（只有標(biāo)準(zhǔn)分析）。

必選1個(gè)
選擇真核有參，則必須配套購買參考基因組數(shù)據(jù)庫

繪圖工具

目前可繪制：熱圖、韋恩圖、柱圖、餅圖、箱線圖、散點(diǎn)圖、點(diǎn)線圖、面積圖，特點(diǎn)：1.調(diào)整圖片樣式（以最佳方式展示數(shù)據(jù)的分布）；2.交互查看（點(diǎn)擊圖片相應(yīng)區(qū)域，查看對(duì)應(yīng)數(shù)據(jù)）。

可選

FASTA工具

FASTA工具集是一款針對(duì)FASTA格式序列的綜合性處理軟件。包括FASTA序列提取、過濾、長(zhǎng)度分布圖繪制、格式轉(zhuǎn)換、統(tǒng)計(jì)等一系列功能。

可選

表格工具

表格工具可對(duì)用戶的各種表格文件進(jìn)行方便快捷的操作，可以實(shí)現(xiàn)表格行列名編輯、表格排序、表格篩選、表格合并的功能。

可選

工具

搭配標(biāo)準(zhǔn)分析完成更多個(gè)性化分析，100+款涵蓋：繪圖、質(zhì)控、數(shù)據(jù)提取、序列分析、比對(duì)、統(tǒng)計(jì)、遺傳進(jìn)化、基因分析、組裝、ncRNA等。

可選
也可以只購買部分工具

數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)

參考基因組數(shù)據(jù)庫

共匯總了975個(gè)物種的861個(gè)基因組信息，其中138個(gè)物種包含190個(gè)參考基因組序列信息。

可選

功能基因數(shù)據(jù)庫

功能基因數(shù)據(jù)庫收錄了25個(gè)數(shù)據(jù)庫的近1700萬條基因的相關(guān)信息，可通過功能關(guān)鍵詞或基因ID進(jìn)行檢索。

項(xiàng)目管理高通量測(cè)序數(shù)據(jù)庫

收錄的SRA項(xiàng)目超過9萬，樣品超過360萬，實(shí)驗(yàn)信息超過260萬。

文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫

與Pubmed同步，增加了過濾欄，可以針對(duì)性查找，簡(jiǎn)化文章檢索后期篩選過程，節(jié)省寶貴時(shí)間，可一鍵保存相關(guān)數(shù)據(jù)。

定制化數(shù)據(jù)庫

整合基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)等多組學(xué)數(shù)據(jù)，呈現(xiàn)給其他人查看和使用。

培訓(xùn)

線上培訓(xùn)

部署后遠(yuǎn)程培訓(xùn)1次（帶考試），時(shí)長(zhǎng)2小時(shí)內(nèi)。
用戶加微信/QQ群進(jìn)行后續(xù)使用交流。

送1次線上培訓(xùn)

線下培訓(xùn)（線上培訓(xùn)后執(zhí)行）

現(xiàn)場(chǎng)培訓(xùn)（包含講師差旅住宿），報(bào)價(jià)為按天收費(fèi)。
培訓(xùn)內(nèi)容1：平臺(tái)使用培訓(xùn)。包括現(xiàn)場(chǎng)演示，課后答疑，上機(jī)操作。
培訓(xùn)內(nèi)容2：平臺(tái)管理員培訓(xùn)。
培訓(xùn)內(nèi)容3：使用平臺(tái)必要的生信知識(shí)培訓(xùn)。

送1次為期2天的線下培訓(xùn)

更新

參考基因組數(shù)據(jù)庫更新

添加可用于APP分析的新的物種或新版本的參考基因組數(shù)據(jù)

可免費(fèi)部署10個(gè)額外版本的參考基因組

系統(tǒng)功能的更新

已部署功能升級(jí)到最新版，包含：平臺(tái)操作系統(tǒng)、管理員系統(tǒng)、用戶系統(tǒng)、數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)、項(xiàng)目系統(tǒng)、已購買分析系統(tǒng)

交付后2年內(nèi)免費(fèi)更新1次

維護(hù)

軟件系統(tǒng)維護(hù)

1、維護(hù)內(nèi)容：系統(tǒng)使用問題解決、任務(wù)異常問題解決、集群調(diào)整及搬遷，保證系統(tǒng)正常使用；
2、服務(wù)時(shí)間：法定工作日*8小時(shí)；
3、響應(yīng)時(shí)間：服務(wù)時(shí)間內(nèi)響應(yīng)時(shí)間為1小時(shí)；服務(wù)時(shí)間外響應(yīng)時(shí)間8小時(shí)。
報(bào)價(jià)包含必要的上門維修費(fèi)用。

交付后1年內(nèi)免費(fèi)維護(hù)

計(jì)算資源調(diào)整

增減或者調(diào)整計(jì)算節(jié)點(diǎn)。按照每臺(tái)每次操作進(jìn)行收費(fèi)。

可選

名稱

詳細(xì)配置

數(shù)量

管理/存儲(chǔ)節(jié)點(diǎn)

2U機(jī)架式服務(wù)器，支持2CPU
具體配置如下：
???– 2個(gè)銀牌4110 CPU（8核/16線程, 2.1GHz, 9.6GT/s, 11MB Cache）
???– 8根16GB RDIMM 2666MT/s服務(wù)器內(nèi)存
???– 4塊600G 10K RPM SAS 12Gbps 2.5英寸企業(yè)級(jí)硬盤
???– 12塊8T 7.2K RPM NLSAS 12Gbps 3.5英寸企業(yè)級(jí)硬盤，實(shí)際可用80T
???– Broadcom 5720 QP 1Gb 網(wǎng)絡(luò)子卡
???– 2個(gè)750W服務(wù)器電源
???– 硬件遠(yuǎn)程訪問控制器
???– 3年4小時(shí)上門服務(wù)（7*24*4）

1

計(jì)算節(jié)點(diǎn)

1U機(jī)架式服務(wù)器，支持2CPU
具體配置如下：
???– 2個(gè)金牌5120 CPU（14核/28線程, 2.2GHz, 10.4GT/s, 19.25MB Cache），共28核
???– 8根32GB RDIMM 2666MT/s服務(wù)器內(nèi)存，共256G內(nèi)存
???– 1塊600G 10K RPM SAS 12Gbps 2.5英寸企業(yè)級(jí)硬盤
???– Broadcom 5720 QP 1Gb 網(wǎng)絡(luò)子卡
???– 2個(gè)750W服務(wù)器電源
???– 硬件遠(yuǎn)程訪問控制器
???– 3年4小時(shí)上門服務(wù)（7*24*4）

2

交換機(jī)

1U機(jī)架式以太網(wǎng)交換機(jī)
具體配置如下：
???– 24個(gè)1Gb 網(wǎng)絡(luò)接口
???– 2個(gè)10GbE SFP+ 光纖接口
???– 3年4小時(shí)上門服務(wù)（7*24*4）

1

機(jī)柜

1 × 19″ 42U 600*1000 標(biāo)準(zhǔn)機(jī)柜
2路PDU
???– 32A工業(yè)連接器輸入
???– 12口10A萬用插口輸出

1