12月21 篇篇捷報(bào)至，累累碩果繁——百邁客云平臺(tái)，您的生信分析智囊團(tuán)

百邁客云作為針對(duì)生命科學(xué)家的“Turn-key?BioCloud”，2015年初出茅廬，2016年開(kāi)始全國(guó)推廣，一路走來(lái)得到了像中科院陳潤(rùn)生院士等生信領(lǐng)域權(quán)威專家的大力支持和幫助。百邁客云日臻完善，集成式的計(jì)算資源和工具、交互性的操作界面、開(kāi)放性的公共數(shù)據(jù)庫(kù)、實(shí)用的培訓(xùn)講堂、專業(yè)的開(kāi)發(fā)支持團(tuán)隊(duì)、一站式體驗(yàn)?zāi)Ｊ?，成為廣大科研工作者生信分析智囊團(tuán)，極大地加速了科研創(chuàng)新孵化進(jìn)程，僅2017年一年內(nèi)基于BMKCloud分析發(fā)表的SCI可謂是層出不窮,捷報(bào)頻傳。

研究熱點(diǎn)揭秘

截止到11月3日，已發(fā)SCI數(shù)達(dá)到19篇，研究對(duì)象涵蓋了糧食作物、經(jīng)濟(jì)作物、人、家禽家畜、水產(chǎn)、林木、花卉、瓜果等類型。植物類占比52.63％，動(dòng)物類占比42.11％，醫(yī)學(xué)類占比5.26％。發(fā)表的雜志有Archives of Toxicology（IF=5.905）、Frontiers in Plant Science（IF=4.298）、Scientific Reports?（IF=4.259）等。累計(jì)影響因子為65.3。

云平臺(tái)對(duì)這些文章都做了詳盡梳理解析，點(diǎn)擊即可查看：

OsbZIP46、SAPK6基因共同過(guò)表達(dá)提升水稻抗旱能力Frontiers in Plant Science IF:4.298

通過(guò)轉(zhuǎn)錄組分析揭示馬杜霉素在原代雞心肌細(xì)胞中的毒性Archives of Toxicology ?IF:5.905?

小麥與禾谷胞囊線蟲(chóng)在侵染初始階段的轉(zhuǎn)錄組響應(yīng) Scientific Reports IF:4.259

蕪菁花芽轉(zhuǎn)錄組比較分析解析多倍體異常減數(shù)分裂過(guò)程Frontiers in Plant Science IF:4.298

單側(cè)眼組織缺損和視網(wǎng)膜裂癥的家族遺傳原因Sci Rep .IF:4.259

圖1 2017年基于BMKCloud分析發(fā)表的部分SCI文章

產(chǎn)出單位分布

從通訊作者所屬地域來(lái)看的話，這些云平臺(tái)的用戶主要分布在全國(guó)12個(gè)省、直轄市，其中產(chǎn)出最多的單位是南京農(nóng)業(yè)大學(xué)，17年基于BMKCloud發(fā)表了3篇SCI（累計(jì)IF 13.23），短期連發(fā)多篇文章的老師也不少，南海水產(chǎn)所喻達(dá)輝老師4個(gè)月內(nèi)連發(fā)兩篇（累計(jì)IF 6.298），南京農(nóng)業(yè)大學(xué)的張艷麗老師更是在短短2個(gè)月內(nèi)連發(fā)兩篇（累計(jì)IF 7.329）

圖2 部分科研單位的地理分布

分析平臺(tái)熱度排行

百邁客BMKCloud已推出25款分析平臺(tái)，包括真核生物有參轉(zhuǎn)錄組、真核生物無(wú)參轉(zhuǎn)錄組、小RNA、長(zhǎng)鏈非編碼RNA、微生物多樣性、重測(cè)序、ChIP-Seq、CircRNA、全轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析等多個(gè)平臺(tái)，覆蓋轉(zhuǎn)錄調(diào)控、微生物多樣性、個(gè)體重測(cè)序、群體個(gè)性化分析等多種組學(xué)分析項(xiàng)目，可滿足所有分析高通量測(cè)序數(shù)據(jù)整合分析及深度挖掘的需求。

從2017年已發(fā)表的SCI文章來(lái)看，使用頻率最高的是有參轉(zhuǎn)錄組分析平臺(tái),占比63％，lncRNA分析平臺(tái)和小RNA分析平臺(tái)占比11％，另外醫(yī)學(xué)外顯子分析平臺(tái)、微生物多樣性分析平臺(tái)、甲基化分析平臺(tái)各占比5％。

圖3 百邁客分析平臺(tái)使用熱度一覽

云課程 讓生物信息更簡(jiǎn)單

BMKCloud部署了185+課時(shí)的線上培訓(xùn)，囊括RNA系列、DNA系列、生物信息軟件使用和大家講壇等課程，每款A(yù)PP（分析平臺(tái)）都有詳細(xì)說(shuō)明及步驟提示，無(wú)論有沒(méi)有生物信息學(xué)基礎(chǔ)，用戶都能夠在短期內(nèi)玩轉(zhuǎn)各類分析。這些作者中有42.86％的老師是完全不懂生信的，約有50％的老師略知一二，僅7.14％對(duì)生信分析較了解。

BMKCloud熱門個(gè)性化分析

除了主流程APP之外呢，BMKCloud上也部署了104個(gè)分析工具、3款工具集。涵蓋12大功能類別（基因分析、遺傳進(jìn)化、ncRNA、質(zhì)控、組裝、比對(duì)、數(shù)據(jù)提取、突變、統(tǒng)計(jì)、表格處理、繪圖、序列分析等）?；旧峡蓾M足所有轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析的需求。圖4展示了19篇文章中熱門的個(gè)性化分析

圖4 BMKCloud個(gè)性化分析示例

僅從這19篇SCI內(nèi)相關(guān)分析內(nèi)容來(lái)看的話，使用次數(shù)最高的分析依次是GO分析、熱圖、KEGG分析、韋恩圖和COG分析。其中熱圖和GO分析使用率最高，均達(dá)到52.63%（圖5）；此外共表達(dá)趨勢(shì)分析，蛋白互作分析等分析也應(yīng)用較多。

圖5 BMKCloud個(gè)性化分析熱度一覽

?

BMKCloud的便捷度

BMKCloud使用便捷，助您多角度進(jìn)行分析挖掘，隨時(shí)隨地抓住分析靈感。

這些研究者中有35.71％的老師選擇在8：00-19:00進(jìn)行分析，選擇晚上進(jìn)行分析的老師占比21.43％，凌晨進(jìn)行分析的占比7.14％。

這些研究者中所有擁有BMKCloud年賬號(hào)的用戶會(huì)對(duì)同一批樣本進(jìn)行2-4次分析和挖掘，而實(shí)現(xiàn)這些僅需要修改參數(shù)、閾值或更換參考基因組等后重新投遞任務(wù)即可。避免了傳統(tǒng)科技服務(wù)模式中多環(huán)節(jié)溝通，多次收費(fèi)，出錯(cuò)率高的問(wèn)題。

BMKCloud的速度

幾乎所有的研究者從拿到數(shù)據(jù)到分析完成所需周期都在3個(gè)月內(nèi)。35.7%的研究者1個(gè)月內(nèi)就完成了文章內(nèi)的全部分析內(nèi)容，其他的研究者拿到數(shù)據(jù)到發(fā)表文章的周期都控制在6個(gè)月內(nèi)。其中，中國(guó)農(nóng)科院油料研究所胡瓊老師項(xiàng)目組使用有參轉(zhuǎn)錄組分析平臺(tái)投遞了200G數(shù)據(jù)，7天就完成了整個(gè)主流程及個(gè)性化分析。

BMKCloud的口碑

云平臺(tái)分析和文章轉(zhuǎn)化的高效贏得了15000+用戶以及廣泛的認(rèn)可度，所有研究者都對(duì)我們的演示、售后及便捷度做出了很高的評(píng)價(jià)，并表示愿意推薦給身邊的科研同事及圈內(nèi)朋友。2017年借助BMKCloud取得累累碩果的研究者們對(duì)云平臺(tái)評(píng)價(jià)如下：

（1）簡(jiǎn)單方便（流程標(biāo)準(zhǔn)化，圖形化，操作簡(jiǎn)單，使用快捷，節(jié)省時(shí)間）；

（2）靈活自由（參數(shù)設(shè)置可隨意更改，可隨時(shí)隨地分析以及查看進(jìn)度）；

（3）可重復(fù)（可多次分析，分析工具種類多樣，可以幫助挖掘出新的分析點(diǎn)）；

（4）云課堂以及文獻(xiàn)資源很實(shí)用；

（5）數(shù)據(jù)儲(chǔ)存空間大；

（6）公共數(shù)據(jù)庫(kù)是大亮點(diǎn)。

廣大科研用戶的肯定，科研探索的累累碩果是對(duì)我們最好的肯定與鼓勵(lì)。百邁客將一如既往地秉承“成就客戶”的服務(wù)理念，持續(xù)迭代開(kāi)發(fā)“云模式”，繼續(xù)引領(lǐng)科技服務(wù)2.0時(shí)代，更好地服務(wù)于廣大科研工作者。也希望越來(lái)越多的課題組能夠享受到云平臺(tái)的便捷與高效，發(fā)表更多更優(yōu)質(zhì)的文章！

?

年末福利

年底我們對(duì)老客戶發(fā)文有感恩活動(dòng)，如果您基于平臺(tái)分析發(fā)表了SCI文章并引用了BMKCloud或cigarsoftampa.com，即可獲贈(zèng)1個(gè)月現(xiàn)有賬號(hào)使用權(quán)限！

?

BMKCloud有別于傳統(tǒng)的“服務(wù)器+命令行”的生信分析模式，是一種人人都可以分析的新型分析模式。百邁客云平臺(tái)代表了科技服務(wù)的新趨勢(shì)，我們已步入云端可視化自主分析的基因科技服務(wù)2.0時(shí)代了！

為感恩回饋各位新老用戶對(duì)百邁客云的支持與關(guān)注，百邁客云現(xiàn)推出72款生物信息分析小工具供免費(fèi)使用，希望在科研路上助您一臂之力！注冊(cè)百邁客云平臺(tái)即可免費(fèi)使用。