01月08 這是一個神奇的網(wǎng)站……(下)

隨著測序成本越來越低，一些重要物種數(shù)據(jù)呈指數(shù)級積累，其中蘊含著巨大價值。物種數(shù)據(jù)研究能為解答基因組進化學、系統(tǒng)發(fā)育學問題提供參考，有利于指導育種工作及保護物種多樣性。因此構(gòu)建物種數(shù)據(jù)庫具有重要意義：

01物種數(shù)據(jù)庫可作為系統(tǒng)性的展示、查詢、分析的平臺：實現(xiàn)物種多組學數(shù)據(jù)的高效檢索、保存、調(diào)用、分析及深度挖掘。

02一些具備創(chuàng)新特性的數(shù)據(jù)庫也可單獨作為一項研究成果在SCI論文中進行展示。

03通過共享云用戶的訪問，可提升第三方數(shù)據(jù)庫的知名度，部分重要物種信息、重要分析結(jié)果可以收費下載，為進一步維護數(shù)據(jù)庫和科研工作提供資金。

04共享研究成果，促進業(yè)內(nèi)交流：數(shù)據(jù)庫可作為研究論文的補充，展示研究細節(jié)，也便于其他研究者基于數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)進行進一步的探索，從而提升國內(nèi)相關(guān)領(lǐng)域整體研究水平。

 

1.百邁客云物種數(shù)據(jù)庫概述

百邁客作為一家擁有深厚基因組學數(shù)據(jù)分析行業(yè)背景的大數(shù)據(jù)挖掘分析公司，致力于為用戶設(shè)計更貼合使用習慣的基因組學數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)，在2017年正式推出搭建百邁客云物種數(shù)據(jù)庫的服務。

簡單來說，百邁客云物種數(shù)據(jù)庫是針對物種基因組學數(shù)據(jù)的存儲、管理、查詢、分析的數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)。用戶基于Web操作界面即可實現(xiàn)數(shù)據(jù)的增刪改查等操作，還可以利用數(shù)據(jù)庫部署的簡單分析工具或結(jié)合百邁客云賬號進行數(shù)據(jù)挖掘分析。

說了那么多是不是有些心動了呢？

跟隨小編一起看下百邁客云物種數(shù)據(jù)庫核心優(yōu)勢有哪些。

2.百邁客云物種數(shù)據(jù)庫優(yōu)勢

多維度部署：多組學數(shù)據(jù)（轉(zhuǎn)錄組、基因組、重測序數(shù)據(jù)）高度整合與部署快捷部署：模塊化的數(shù)據(jù)庫底層設(shè)計，可基于需求抽取底層庫標準化數(shù)據(jù)存儲檢索模塊及頁面樣式模塊，快速完成在本地服務器或百邁客云數(shù)據(jù)庫用戶服務集群上的部署

操作更簡單：后臺管理權(quán)限，甲方無需配備專業(yè)IT運維和美工，在乙方培訓后，即可完成后期的數(shù)據(jù)增加、刪除等更新操作

查詢調(diào)用更高效：代替原始的硬盤存儲+手動查找的傳統(tǒng)數(shù)據(jù)管理模式，引入互聯(lián)網(wǎng)領(lǐng)域的數(shù)據(jù)庫技術(shù)，可將各時間點、各空間點、各類型數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)化地存儲于統(tǒng)一的數(shù)據(jù)庫框架中，借助數(shù)據(jù)庫自動查詢語言與web2.0網(wǎng)頁界面即可實現(xiàn)基因組學數(shù)據(jù)的高效查詢和調(diào)用。避免了傳統(tǒng)數(shù)據(jù)管理模式下數(shù)據(jù)丟失率高及檢索困難等問題

數(shù)據(jù)挖掘更輕松：強大的云平臺支持，可連接百邁客云其他數(shù)據(jù)庫（八大數(shù)據(jù)庫，如功能基因庫、參考文獻數(shù)據(jù)庫等），并可使用百邁客云分析工具（如幾十款分析APP、一百多款小工具），基于APP和小工具完成數(shù)據(jù)的深度挖掘

 

3.百邁客共建數(shù)據(jù)庫的成功案例

那么我們看下百邁客有哪些成功案例吧！

中國農(nóng)科院大豆數(shù)據(jù)庫（www.soybean-resources.cn）
包含了約1500種大豆種質(zhì)資源，382個品種的重測序，7套泛基因數(shù)據(jù)。

 

 

中科院植物所構(gòu)樹數(shù)據(jù)庫（papyrifera.biocloud.net）
包含了構(gòu)樹基因組序列及注釋信息，可進行數(shù)據(jù)的瀏覽、使用、下載。

4.數(shù)據(jù)庫搭建流程

01需求論證（2~4周）

用戶設(shè)定模塊組合及各模塊對外權(quán)限，可選擇部署到本地服務器或托管于百邁客云數(shù)據(jù)庫專用集群；
乙方完成原型設(shè)計，并與甲方確認后核算搭建成本并報價，乙方核算報價，甲方支付20%的預付款。

02開發(fā)（3個月）

基于數(shù)據(jù)庫原型，制定出數(shù)據(jù)標準化格式、文本需求信息，協(xié)助用戶數(shù)據(jù)準備工作；
依次完成UI設(shè)計、前端架構(gòu)、后端完成底層數(shù)據(jù)的存儲與頁面相關(guān)交付；進行測試驗收。

03交付

雙方共同完成測試后，甲方需在驗收合格10個工作日內(nèi)支付80%尾款，乙方交付數(shù)據(jù)庫并協(xié)助甲方進行日常維護更新。

04日常維護與更新

每日巡檢，檢查機房用電、溫濕度，服務器硬件報警及維修；
服務器操作系統(tǒng)狀態(tài)監(jiān)控與報警、日常維護、操作系統(tǒng)及軟件版本更新；
服務器生產(chǎn)服務與軟件的狀態(tài)監(jiān)控與報警、版本更新；
數(shù)據(jù)庫服務狀態(tài)監(jiān)控與報警，數(shù)據(jù)定期檢查與備份；
甲方在乙方協(xié)助下自主完成增刪改等操作。